蛋白質の立体構造解析及び構造情報

#112 クライオ電子顕微鏡による膜タンパク質高分解能構造解析の実例
岸 孝一郎
東京大学・総合文化研究科・広域科学専攻

Model case of high-resolution structural analysis of membrane protein by cryo-electron microscopy

公開日:2023/08/26
蛋白質科学会アーカイブ, 16, e112 (2023)
2022年度日本蛋白質科学会若手奨励賞優秀賞受賞者
#109 Humid Air and Glue coating(HAG)法を用いたタンパク質結晶の X 線回折実験プロトコール
馬場 清喜
公益財団法人 高輝度光科学研究センター・構造生物学推進室

Protocol for X-ray protein crystallography by using the Humid Air and Glue coating (HAG) Method

公開日:2022/11/17
蛋白質科学会アーカイブ, 15, e109 (2022)
#108 単粒子構造解析に向けたグリセロール密度勾配遠心法を用いたウェルシュ菌イオタ毒素複合体の調製
山田 等仁
京都産業大学大学院・生命科学研究科

Preparation of C. perfringens iota toxin complex using glycerol density gradient ultracentrifugation for single particle analysis

公開日:2021/12/30
蛋白質科学会アーカイブ, 14, e108 (2021)
2021年度日本蛋白質科学会若手奨励賞優秀賞受賞者
#105 GaREUS 法を用いた自由エネルギー地形の計算
尾嶋 拓
理化学研究所・生命機能科学研究センター

Calculation of Free-Energy Landscape Using the GaREUS Method

公開日:2021/08/30
蛋白質科学会アーカイブ, 14, e105 (2021)
2020年度日本蛋白質科学会若手奨励賞優秀賞受賞者
#103 分子置換法を用いた X 線結晶構造解析
松村 浩由
立命館大学・生命科学部

Molecular replacement in X-ray crystallography

公開日:2021/06/26
蛋白質科学会アーカイブ, 14, e103 (2021)
#101 X 線構造解析に向けたタンパク質結晶のクライオ条件の検討と凍結保存
菱木 麻美
静岡県立大学・薬学部

Cryo-protection of protein crystals for X-ray structure analysis

公開日:2021/06/26
蛋白質科学会アーカイブ, 14, e101 (2021)
#099 クライオ電子顕微鏡を用いた単粒子構造解析に向けた試料凍結スクリーニングと実践~Streptavidin(52 kDa)と P4-ATPase を例に~
平泉 将浩
田辺三菱製薬株式会社・創薬本部・創薬基盤研究所 / 東京大学・大学院理学系研究科・生物科学専攻

Grid Screening and Practice for Single Particle Analysis ~P4-ATPase and Streptavidin (52 kDa) as examples~

公開日:2021/03/04
蛋白質科学会アーカイブ, 14, e099 (2021)
2020年度日本蛋白質科学会若手奨励賞優秀賞受賞者
#095 塩濃度の最適化を利用したポリエチレングリコールベースの新しい結晶化スクリーニングキット
水谷 公彦、水谷 由記子
京都大学・農学研究科

A novel polyethylene glycol based crystal screen kit using optimization of salt concentration

公開日:2019/10/22
蛋白質科学会アーカイブ, 12, e095 (2019)
#093 超分子複合体の立体構造解析を目指したストラタジー~転写メディエーターの X 線結晶構造解析を例として~
野澤 佳世
東京大学・定量生命科学研究所

Structural analysis strategies of biomacromolecular complexes

公開日:2019/01/14
蛋白質科学会アーカイブ, 12, e093 (2019)
2018年度日本蛋白質科学会若手奨励賞優秀賞受賞者
#091 GENESIS を使ったタンパク質分子動力学法計算
小林 千草
理化学研究所・計算科学研究センター・粒子系生物物理研究チーム

Molecular dynamics simulation for protein systems using GENESIS

公開日:2018/09/14
蛋白質科学会アーカイブ, 11, e091 (2018)
#088 タンパク質 NMR 解析のための化学修飾によるリジンおよびグルタミン残基の安定同位体標識法
服部 良一1,2
1大阪大学・蛋白質研究所、2徳島文理大学・薬学部

Stable isotope labeling of lysine and glutamine residues via chemical modification for protein NMR spectroscopy

公開日:2018/04/10
蛋白質科学会アーカイブ, 11, e088 (2018)
#081 シリアルフェムト秒結晶構造解析のための試料調製法:バッチ法による微結晶化と高粘度媒体を利用した結晶送液方法について
南後 恵理子1、菅原 道泰1、小林 淳1、田中 智之1、山下 鮎美1、潘 東青2、田中 良樹3、伊原 健太郎3、寿野 千代3、島村 達郎3
1理化学研究所・放射光科学総合研究センター、2京都大学大学院・薬学研究科、3京都大学大学院・医学研究科

Sample preparation methods for serial femtosecond crystallography: batch crystallization and grease matrix carrier method

公開日:2015/07/04
蛋白質科学会アーカイブ, 8, e081 (2015)
#080 容易かつ明確に(天然)変性蛋白質の溶液NMR信号を帰属する方法
吉村 優一
オーフス大学・iNANO and Department of Chemistry

Liquid-state NMR experiments for easy and unambiguous resonance assignments of (intrinsically) disordered proteins

公開日:2015/04/04
蛋白質科学会アーカイブ, 8, e080 (2015)
#076 緩和分散NMR法による動的構造解析
谷中 冴子、菅瀬 謙治
サントリー生命科学財団・生物有機科学研究所

How to study structural dynamics by relaxation dispersion NMR

公開日:2014/05/06
蛋白質科学会アーカイブ, 7, e076 (2014)
2013年度日本蛋白質科学会若手奨励賞受賞者
#070 真核生物キネトコア複合体CENP-TWSXの調製、結晶化と立体構造解析
西野 達哉
国立遺伝学研究所

Preparation, crystallization and structural analysis of eukaryotic kinetochore complex CENP-TWSX

公開日:2013/03/30
蛋白質科学会アーカイブ, 6, e070 (2013)
#068 脂質キュービックフェーズ法: LCP法(脂質メソフェーズ法)を利用した膜タンパク質の結晶化
加藤 英明
東京大学・大学院理学系研究科

The crystallization of membrane proteins using lipidic cubic and sponge phases (lipidic mesophases)

公開日:2013/02/18
蛋白質科学会アーカイブ, 6, e068 (2013)
#066 良質な蛋白質結晶の育成:ミクロシーディングの標準的な方法
伊藤 廉1、清水 哲哉2、山本 雅貴2
1SPring-8/JASRI、2理研/SPring-8 センター

Optimizing high quality protein crystal growth by seeding methods

公開日:2012/03/01
蛋白質科学会アーカイブ, 5, e066 (2012)
#064 糖蛋白質-抗体複合体の精製と結晶化~α5β1インテグリン-SG/19 Fab断片複合体を例として~
長江 雅倫
理化学研究所・基幹研究所・糖鎖構造生物学研究チーム

Purification and crystallization of glycoprotein in complex with Fab fragment

公開日:2012/02/11
蛋白質科学会アーカイブ, 5, e064 (2012)
#062 RNA/蛋白質複合体の単結晶が得られるまで~Exportin-5/RanGTP/pre-microRNA複合体を例として~
慈幸 千真理
京都大学・生命科学系キャリアパス形成ユニット
公開日:2011/04/30
蛋白質科学会アーカイブ, 4, e062 (2011)
#061 複合体試料の結晶化 ~ヒストンシャペロンCIA/ASF1-ブロモドメイン複合体をモデルとして~
赤井 祐介
(独)産業技術総合研究所・バイオメディシナル情報研究センター
公開日:2011/04/23
蛋白質科学会アーカイブ, 4, e061 (2011)
#059 NMRによる蛋白質の立体構造解析
吉田 卓也
大阪大学・薬学研究科
公開日:2010/08/09
蛋白質科学会アーカイブ, 3, e059 (2010)
#055 表面残基エントロピー減少法による結晶化を目指した蛋白質への変異導入 ―βシートモデル蛋白質の結晶化を例として
真壁 幸樹
自然科学研究機構・岡崎統合バイオサイエンスセンター
公開日:2009/12/19
蛋白質科学会アーカイブ, 2, e055 (2009)
#046 蛋白質の結晶化に向けた蛋白質溶液の新しい調製法
伊藤 廉
関西学院大学大学院・理工学研究科
公開日:2008/11/29
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e046 (2008)
#033 結晶化条件の最適化
志波 智生
東京大学大学院・総合文化研究科
公開日:2008/06/09
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e033 (2008)
#032 蛋白質 X 線結晶構造解析―放射光を利用した回折実験
五十嵐 教之
高エネルギー加速器研究機構・放射光科学研究施設
公開日:2008/06/09
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e032 (2008)
#028 長波長 X 線利用による天然型タンパク質の結晶構造解析
北郷 悠1、渡邉 信久1, 2
1北海道大学 先端生命科学研究院・先端生命科学部門 X 線構造生物学研究室、2名古屋大学 大学院工学研究科・化学・生物工学専攻・生物機能工学分野
公開日:2008/06/09
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e028 (2008)
#027 回折測定~実験室系~(改訂)
清水 敏之、平野 良憲
東京大学大学院・薬学系研究科・蛋白構造生物学教室
公開日:2008/06/09、改訂版公開日:2021/12/07
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e027 (2008)
#025 タンパク質の結晶作成についての私見(改訂)
神田 大輔
九州大学・生体防御医学研究所・構造生物学分野
公開日:2008/06/09、改訂版公開日:2021/03/08
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e025 (2008)
#023 結晶化条件のスクリーニング(改訂)
志波 智生
京都工芸繊維大学・応用生物学系
公開日:2008/06/09、改訂版公開日:2022/02/28
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e023 (2008)
#021 クライオ条件の検討
橋本 博
横浜市立大学・国際総合科学研究科
公開日:2008/06/09
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e021 (2008)
#016 X 線結晶構造解析―分子置換法
松村 浩由
大阪大学大学院・工学研究科・応用化学専攻
公開日:2008/06/09
蛋白質科学会アーカイブ, 1, e016 (2008)